壹般馬蹄育苗方法有高密度育苗和稀植育苗兩種。
壹、高密度育苗法
這種方法廣泛為湖南馬蹄產區所采用，它的特點是：用種量大，苗齡短，苗期管理方便，苗床可利用各種空坪隙地，不需占用稻田。
馬蹄高密度育苗壹般在移栽前20~25天進行，苗齡最多不超過30天，具體育苗時間依據前作收獲遲早而定。前作是早稻的，壹般安排在“小暑”前後育苗，前作是席草田或紅花草子留種田的可提早育苗。
在馬蹄育苗之前，先要選好、整好苗床。馬蹄苗床應選擇水源充足、排灌方便的樹蔭下或瓜棚下，以利遮蔭防曬，房前屋後的露天場地也可作苗床，但必須用草簾或樹枝搭棚遮蔭，用籬笆圍牢，防止雞、鴨、鵝和其他家禽、家畜糟踏。苗床要平整，底土不滲漏，床寬100~130厘米，長度可因地形和播種量而定，苗床四周築壹條10~15厘米高的小堤，床內不需泥土。
在整好苗床後便可排種。應註意選用種形圓滿，單個較大且均勻壹致，無病蟲危害，無人為機械創傷的健壯馬蹄排種。選好的馬蹄種可直接排於苗床，也可以先催芽後排種。
馬蹄催芽的具體方法是：將馬蹄種置於清水中浸泡2~3夜，再裝入籮筐，每天淋水3~5次，保持潮濕，待種芽萌發露白時排種。每畝大田用種量為65~70公斤，單個球莖大的需種量大，反之需種量少。排種從苗床壹端開始，壹個緊挨壹個，但種球不互相重叠，種芽朝上，放平放穩即可。排完種球後，蓋上壹層細黃土或過篩的肥沃菜園土，厚度以淹沒薺頂即可，如能蓋壹層拌了人糞尿的火土灰，更有利於培育壯苗。
馬蹄排種後苗床應經常灌水，保持其濕潤，防止斷水幹旱。灌水要小心，不要將種球上的細土沖掉。在馬蹄幼苗移栽前5~7天，逐漸揭開蔭棚煉苗，使其適應高溫強光環境。這種育苗法因苗齡較短，幼苗靠吸收種球內的養分得以生長，不需施用肥料。但整個育苗階段要註意防止老鼠和麻雀危害。
二、稀植育苗法
此法又叫分株繁殖，其特點是：苗齡長，用種少，成本低，特別是引進數量不多的新品種時，采用此法育苗，可利用較小的種球培育出大量的種苗。
荸薺高稀植育苗應選擇泥腳深淺適中、土壤肥沃、排灌條件較好的水田，並於種苗定植秧田之前進行整地，結合整地施足底肥，以供幼苗生長之需。
按照上述介紹的密植育苗方法，將種苗培育成40~60厘米高時，移入到預先平整好的秧田裏進行繁殖，苗距150~180厘米見方，每穴種壹株，註意不讓種球脫落，使植株移栽到秧田乏後仍有種球供給養分。
馬蹄秧苗定植後3~5天返青，並陸續發生分蘗，形成新的植株，新植株的側芽向四周抽出葡匐莖，葡匐莖伸長10~15厘米後，其頂端肉質莖的頂芽，又向上萌生葉狀莖，形成分株，分株又以同樣的方式發生分枝和分蘗，形成株叢。馬蹄分株發生快慢與肥料和氣溫等因素有關，肥料足，氣溫在25~30度時，分株發生最快，壹個分株約10~15天便可發壹檔分株。