我省黃金玉米帶多年來為平衡全國糧食供求、穩定糧食市場做出了巨大貢獻。但是，黃金玉米帶的開發和保護還存在壹些亟待解決的問題，如實現現代農業基礎薄弱，區域品牌推廣不夠，土壤保護不夠，種植面積減少，環境汙染加劇，防災抗旱能力弱，品種優化不夠，黑土資源侵占嚴重，威脅糧食安全。因此，保護黃金玉米帶迫在眉睫。近年來，吉林省委、省人大、省政府、省政協通過立法、投入、監督等多種有效措施，加大了對黃金玉米帶的保護力度，取得了壹定成效。但是，不容忽視的是，有些問題還沒有得到很好的解決:
1，壹家壹戶的分散經營與現代農業發展不相適應。聯產承包責任制在80年代無疑是進步的，適應了當時的生產力發展水平。然而，經過30年的改革開放，隨著經濟的快速發展，農業現代化水平的提高，農民逐漸富裕起來，農村經濟組織和經紀人不斷湧現，農村組織形式出現了壹些不適應的問題，不利於規模經營和農業技術的進步。目前，我省農村土地基本上是按照現有人口平均分配，整個土地被分割成很多小塊，進行家庭經營。由於耕地面積小，農民只能采用傳統的耕作方式，機械化生產難以實現。我省大部分農戶經營的土地面積不到2公頃，而世界中等收入及以上國家平均每生產單位面積為76.5公頃，美國農戶平均家庭經營規模超過100公頃。人均農地資源少，這種組織的形成有利有弊，即很多農民無法真正離開土地安心從事非農產業，而從事農業生產的農民無法通過擴大生產面積實現規模經濟，同時造成壹定程度的人力物力浪費。
2.玉米的食用價值和優質營養成分被淡化，被忽視。玉米是世界三大主要農作物之壹，世世代代為人類的生存和繁衍做出了巨大貢獻。玉米是最好的主食。2006年，全球玉米消費量占糧食總量的29.7%。玉米被稱為“生命食品和黃金食品”，因為它的各種營養成分超過了大米和小麥。壹位美國專家說:“玉米對人類最大的貢獻在於，它富含將玉米染成金黃色的色素——葉黃素和玉黃，這是強有力的抗氧化劑。玉米中的葉酸是大米的3倍，鉀和硒是大米的3.6倍。玉米含有多種抗癌因子，如谷胱甘肽、葉黃素、硒、鎂、煙酸和優質纖維，證明玉米是不可替代的健康食品，是最佳主食。”2006年，美洲國家玉米人均消費量為132.5斤，美國為117.6斤。玉米在控制疾病、調整飲食結構、保護人體健康方面具有重要作用。近年來，玉米的食用價值被淡化，玉米被貼上了“粗糧”的標簽，吃玉米被視為“窮命”的表現。有些人以主食大米和白面為榮，不知道玉米的真實面目，從而打破了膳食結構的平衡。糖尿病、肥胖和“三高”人群的增加與玉米消費不足有直接關系。
3.區域品牌推廣力度不夠。吉林省黃金玉米帶是吉林省乃至中國和亞洲寶貴而稀有的土地資源。其農業地位十分重要，其區域品牌價值與長白山具有同等重要的地位。所以應該引起省內各界的關註和重視。但我省對黃金玉米帶的宣傳力度不夠。很多人不知道黃金玉米帶，玉米的第壹食用屬性，玉米是最好的主食。輿論宣傳不夠全面科學，對黃金玉米帶缺乏關註和保護引導。
4.土壤保護不足。吉林省黃金玉米帶的黑土是地球上的稀有資源，也是世界三大黑土資源之壹。由於化學農藥的大量使用，農民傳統的耕作方式已經被除草劑所取代。由於常年過量施用化肥農藥，土壤結構發生變化，土地板結。再加上多年的水土流失，短短30多年，黃金玉米帶的黑土厚度從60-70厘米減少到20-30厘米。黑土層厚度大於20 cm的耕地僅占全省黑土耕地的30.5%，厚度為18-20cm的黑土耕地占全省黑土耕地的42.3%。據測算，我省黑土表層年均流失量約為0.4-0.5厘米，屬於中度和強烈侵蝕。如果不加緊治理，再過50年，黑土地將失去，耕地將失去生產能力，舉世聞名的黃金玉米帶也將不復存在。
5.種植面積逐年減少。我省黃金玉米帶播種面積不斷下降。土壤是人類生存和發展的物質基礎。隨著耕地的高度開發和不合理利用，加上土地沙化等原因，我省部分耕地土壤結構遭到破壞。沙化土地以年均65438±0.4%的速度擴大，嫩江下遊鹽漬化面積向東擴大，重度和中度鹽堿地面積增加。與此同時，科爾沁沙地東側沙化土地不斷擴大，幾乎與大面積鹽堿化相連，在壹定程度上威脅著我國中部糧食主產區的黃金玉米帶。雖然措施取得了壹定成效，但生態環境的不良趨勢沒有得到根本改善，荒漠化土地治理的長期性、艱巨性和復雜性沒有根本改變，仍然面臨許多困難和問題。
6.環境汙染加劇。黃金玉米帶不僅貢獻了豐富的產品，也付出了高昂的成本和代價。現有黃金玉米帶耕地整體質量下降，存在壹些區域性汙染嚴重的突出問題。耕地有機質含量低，土壤養分不平衡。由於在開發上缺乏規劃，粗放耕作、輕耕細作，黑土的自然修復能力遭到破壞，導致部分耕地土壤退化，水土流失嚴重，作物養分減少，表土存量流失，土層逐年變薄，有機質含量明顯下降。每年流失的黑土，換算成標準化肥的氮磷鉀流失量驚人，所以“保護黑土，愛護大糧倉”成了重中之重。
7.防災抗旱能力弱。我省黃金玉米帶農業基礎設施差，農業機械化程度低，灌溉資源薄弱，抗災能力弱。水旱災害，尤其是幹旱，導致玉米帶糧食生產波動較大，極大地影響了玉米品質的提高和產量的增加。
8.品種優化不夠。吉林省栽培的玉米品種抗旱、抗倒伏能力差，專用玉米品種較少，優良品種有限。在我國基本解決溫飽問題後，玉米的食用價值已經動搖，人們對養育了我們祖先、世代和吉林人的玉米產生了困惑。據統計，目前作為口糧的玉米僅占總產量的15%左右，其食品安全已成為當前應關註的重要問題。