1.產地區別:漢源花椒位於四川省雅安市漢源縣，毛文花椒位於四川省阿壩藏族羌族自治州茂縣。種植環境和土壤條件會因為產地不同而不同。
2.外觀差異:漢源花椒果實呈紅色或紫色，皮紋小而光滑，顆粒大小和飽滿度相對較差；毛文花椒果實紫紅色或微黃色，皮紋大，有皺紋，顆粒飽滿。這些外貌特征使得他們在外貌上有著明顯的差異。