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瓊脂糖凝膠電泳拖尾了怎麽辦?

跑過瓊脂糖凝膠電泳的小夥伴,是不是經常遇到過電泳拖尾的現象啊?相信不少人點頭如搗蒜了。提個質粒拖尾,提個DNA拖尾,連PCR也拖尾,拖尾什麽的最常見了。驗證也就算了,關鍵是圖片拍出來不好看了,發文章什麽的太影響檔次了。下面我就跟據自己的經驗跟大家講講瓊脂糖凝膠電泳為什麽會拖尾,有不足的希望大家多多評論補足啊(三人行必有我師嘛)!!

那瓊脂糖凝膠電泳為什麽會拖尾呢?

1.PCR產物出現拖尾的因素有很多,總結為壹條,就是非特異性擴增過多。原因可能是:

(1)模板不純:純化模板

(2)Buffer不合適:更換Buffer

(3)退火溫度偏低:適當提高退火溫度

(4)酶量過多:適量用酶,或調換另壹種酶

(5)dNTP、Mg2+濃度偏高:適當降低dNTP和鎂離子的濃度

(6)循環次數過多:減少循環次數

(7)模板量少或引物量過多:增加模板量,減少引物的用量

2.提質粒的時候經常有這種個現象,有可能是樣品濃度過高了。這種情況簡單,稀釋壹下就行了。

3.提基因組DNA的時候也常出現拖尾,最可能的就是提的DNA中摻雜有蛋白質,蛋白質會拽DNA的泳動。所以壹定要註意提取基因的操作,減少蛋白質等雜質的出現。

4.樣品破碎或是被降解

5.存在RNA:DNA前面的壹片壹般都是未清除的RNA,經過純化,RNAse處理,就沒有了

6.電泳體系的問題:觀察妳的marker是否也存在拖尾現象,作為對照

(1)電泳緩沖液TAE或者TBE的汙染:。建議更換緩沖液。

(2)上樣時樣品漂了,建議增加上樣緩沖液的用量,以及小心加樣。

(3)電壓太高:適當降低電壓

(4)根據核酸片斷大小,適當把加大凝膠濃度。凝膠濃度的選擇取決於DNA分子的大小。分離小於0.5kb的DNA片段所需膠濃度是1.2-1.5%,

分離大於10kb的DNA分子所需膠濃度為0.3-0.7%, DNA片段大小間於兩者之間則所需膠濃度為0.8-1.0%。/s/QZbboqNBDce2QFPD8JxFCw