1、來源上的區別
紅花：原產中亞地區，日本、朝鮮都有種植。國內河南、新疆、甘肅、山東、浙江、四川西藏也有種植。
西紅花：主要分布在歐洲、地中海及中亞等地。
2、性狀上的區別
紅花：不帶子房的管狀花，長1—2cm。表面紅黃色或紅色。花冠筒細長，裂片呈狹條形，長5—8mm，花藥聚合成筒狀，黃白色；柱頭長圓柱形，頂端微分叉。質柔軟。氣微番，味微苦。
西紅花：呈線形，三分枝，長約3cm。暗紅色，上部較寬而略扁平，頂端邊緣顯不整齊的齒狀，內側有壹短裂隙，下端有時殘留壹小段黃色花柱。體輕，質松軟，無油潤光澤，幹燥後質脆易斷。氣特異，微有刺激性，味微苦。
3、顯微上的區別
紅花：粉末橙黃色。花冠、花絲、柱頭碎片多見，有長管狀分泌細胞常位於導管旁，直徑約至66mm，含黃棕色至紅棕色分泌物。花冠裂片頂端表皮細胞外壁突起呈短絨毛狀。
柱頭和花柱上部表皮細胞分化成圓錐形單細胞毛，先端尖或稍鈍。花粉粒類圓形、橢圓形或橄欖形，具有3個萌發孔，外壁有齒狀突起。草酸鈣方晶存在於薄壁細胞中。
西紅花：粉末橙紅色。表皮細胞表面觀長條形，壁薄，微彎曲，有的外壁凸出呈乳頭狀或絨毛狀，表面隱約可見纖細紋理。柱頭頂端表皮細胞絨毛狀，表面有稀疏紋理。草酸鈣結晶聚集於薄壁細胞中，呈顆粒狀、圓簇狀、梭形或類方形。
4、化學成分上的區別
紅花：含有紅花甙、新紅花甙和紅花醌甙、二十九烷B-谷甾醇、棕櫚酸、肉豆蔻酸、月桂酸、二棕櫚酸甘油酯、油酸、亞油酸、B-谷甾醇-3-O-葡萄糖甙、多糖(基本組成為B-鍵連接的葡萄糖、木糖、阿拉伯糖和半乳糖)
西紅花：含胡蘿蔔素類化合物。番紅花苷、番紅花酸、玉米黃質、番紅花苦苷、揮發油，還有案腦、蒎烯等。又含豐富的維生素B1、B2，球莖含葡萄糖、氨基酸、皂苷。
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