紫薯又叫黑薯，其肉呈紫色至深紫色。它除了含有普通紅薯的營養成分外，還含有豐富的硒和花青素。紫甘薯是花青素的主要原料之壹。紫色是紫甘薯中的花青素，分子量為287.246，分子式為C15H11O6。它是壹種廣泛存在於植物中的水溶性天然色素，屬於黃酮類化合物。它也是植物花瓣中的主要著色物質。花青素存在於植物細胞的液泡中，可以由葉綠素轉化而來。低溫、缺氧、缺磷也會促進花青素的形成和積累。
近年來，人們開始關註食物營養，發現紫薯的營養價值很高。各地農業科研單位培育出許多產量高、質量好的紫薯新品種，市場上紫薯數量增多，價格高於普通品種。許多食物含有花青素。在眾多紫色食物中，紫薯不僅產量高、成本低；而且花青素含量也高，所以備受青睞。最近不斷有關於紫甘薯的研究論文發表，如2009年發表在《現代食品技術》上的《紫甘薯花色苷的光譜特性及抗氧化活性研究》。研究表明，紫甘薯花色苷具有較強的抗氧化作用。
中國農業大學食品學院營養與食品安全系副教授範誌紅指出，“事實上，天然植物的形狀本來就多種多樣。同樣的東西，大大小小，五顏六色。人們只看到壹個尺寸壹個顏色的產品，只是因為這個品種被人類廣泛種植。例如，通過將各種番茄品種相互雜交，可以生產出不同顏色的番茄，如深紅色、粉紅色、黃色和綠色，以及不同大小的番茄。這些都是正常的事情，與轉基因無關。就像不同民族的人，不同種族通婚後，會生出鼻梁高矮、口型、眼睛和發色、身高身高都發生了變化的混血兒。相反，有些轉基因產品往往看起來很正常，所以不能用顏色或大小來判斷是不是轉基因產品。”
中國疾病預防控制中心營養與食品安全所研究員何教授給出了權威解答:“關註常見問題:根據農業部農業轉基因生物安全管理辦公室2013年4月27日發布的信息，截至當時，我國已對耐儲藏番茄、抗蟲棉、變色矮牽牛、抗病辣椒、抗病木瓜、抗蟲水稻、抗蟲水稻等7種轉基因植物頒發了農業轉基因生物安全證書。紫薯不在此列，這給了我們壹個非常權威的答案，那就是紫薯不是轉基因食品，它是天然食品。