先泡黃豆，將洗幹凈的黃豆，放入水中浸泡10小時，泡脹後再開始制作。將泡好的黃豆攤在盤子裏，然後放入高壓鍋中用大火煮10分鐘。當然，如果想要更好的口感，也可以選擇小火蒸壹個小時左右，直到黃豆很容易被壓碎。黃豆蒸好後放在壹邊晾涼備用，然後就可以準備其他材料了。
制作納豆，要取適量納豆菌，用少量冷開水洗凈，也可以選擇用剛蒸好的豆子的豆汁溶解這些納豆菌。溶解後可以直接攪拌剛蒸好的黃豆中的納豆菌。如果之前準備了納豆，也可以直接把之前的納豆交出來，放入黃豆中攪拌均勻，再把攪拌好的黃豆放入納豆機中。
吃法:打開納豆機，等待納豆發酵20小時左右。剛看到黃豆表面有壹層白色的薄膜，還有畫畫的效果，納豆就相當於做好了。制得的納豆可以直接食用。如果短時間內吃不完，也可以用保鮮膜密封，放入冰箱保存。很多網友表示接受不了納豆的味道。其實他們可以把納豆放到其他涼菜裏拌著吃，可以掩蓋壹部分納豆的味道。