1、植物種類 。荸薺和馬蹄雖然都屬於荸薺屬植物，但荸薺屬於荸薺亞屬，而馬蹄則屬於馬蹄亞屬。但通常來說，荸薺就是馬蹄，二者是壹種植物的兩種不同叫法。馬蹄是荸薺的俗稱，只是因為荸薺的地下球莖外形類似於馬蹄而得名。
2、外觀形態 。荸薺通常呈扁圓形或圓形，顏色有紫紅色、深紅色、深褐色或暗綠色，表面有明顯的皺紋或凸起；馬蹄呈圓錐形、扁圓形或橢圓形，顏色有紫黑色、深灰色、淺黃色或黃褐色，表面較為光滑。
3、口感味道 。荸薺肉質細嫩，口感清甜、清脆且汁多味美；馬蹄肉質相對粗硬，口感清淡，略帶苦澀或更為柔軟。
4、營養價值 。二者都含有豐富的水分、維生素、礦物質和膳食纖維等。但荸薺還富含蛋白質、脂肪、碳水化合物、胡蘿蔔素等，特別是磷的含量很高；而馬蹄含有較多的粗蛋白、澱粉以及荸薺英等成分。
5、藥用價值 。荸薺可以清熱瀉火、利尿通便、消食化積；馬蹄可以清熱解毒、生津止渴。
6、產地 。荸薺主要產於南方地區，如廣東、福建、浙江等地；馬蹄主要產於北方地區，如江蘇、山東、安徽等地。