在有機食品大米的生產加工中，絕對禁止使用農藥、化肥、生長調節劑等合成物質，禁止使用轉基因品種。因此，有機食品的生產要比綠色食品困難得多，需要建立全新的生產體系，采用相應的農業替代技術。
有機食品水稻生產體系的特點是選擇抗性強的作物品種，利用稭稈還田，施用綠肥和無害動物糞便培肥土壤，保持養分循環，采用物理和生物措施防治病蟲草害，采用合理的耕作措施保護環境，防止水土流失，維護生產體系和周圍環境的生物和遺傳多樣性。註重養分在系統中的循環，以維持和提高土壤肥力，依托生態系統管理，因地制宜發展當地的自養系統。它是壹種以生態效益為優先發展目標的農業生產方式，體現了農業可持續發展的要求。有機食品大米需要滿足以下四個條件:
(1)原料必須來自有機農業生產體系。
(2)產品在整個生產過程中嚴格遵循有機食品的生產、加工、包裝、儲運標準。
(3)在有機食品生產和流通過程中，生產者有完善的質量跟蹤和審查制度，有完整的生產和銷售記錄。
(4)必須經過獨立的有機食品認證機構認證。