2.泡豆:將黃豆放入容器中，按照1: 3的比例用水浸泡，浸泡時間為12 ~ 15小時(夏季約10小時)。泡豆的時候要放在陰涼的地方，泡黃豆最好是之前的兩倍。
3、攪拌:浸泡過的豆子，用篩子等工具控制水分晾幹。將納豆芽孢桿菌培養基(1小勺糖和半小勺味精)舀入浸泡幹凈的豆子中，攪拌均勻。1勺=5g。
4.蒸:將泡好的豆子大火蒸5分鐘，小火蒸90分鐘左右。直到豆子成熟。
5.接種納豆芽孢桿菌:趁熱將煮熟的黃豆連同豆汁壹起移入已清洗幹凈並用開水燙過的大碗中，上下翻動，冷卻至45度。打開壹粒納豆芽孢桿菌膠囊，取其中的1%，用20ml冷開水溶解，倒入3-5滴蒸好的豆子中，用無菌筷子或勺子攪拌均勻，蓋上濕紗布(防止發酵時水滴落入納豆中)，放入酸奶機中。內膽的蓋子沒蓋，機器外面的蓋子蓋了。紗布的壹角露在外面，便於空氣流通。
6.發酵:開啟酸奶機電源，保持溫度在40℃左右20-24小時進行充分發酵(夏季發酵時間約為16-20小時)，發酵時間由個人決定。標準是納豆攪拌時能拉出很多絲。發酵完成後，納豆要放入冰箱冷藏壹夜，煮熟。做出來的納豆外觀和口感會更好。