防城港地理位置和地緣條件得天獨厚。港灣水深、避風、航道短且不淤積，城、陸域寬闊，可用岸線長。港口處於中國大西南地區與東南亞地區中心，背靠大西南經濟腹地；西鄰越南鄰粵、瓊、澳頻東南亞，是大西南走向東南亞和走向世界最便捷的出海通道。1983年，防城港被國務院列為對外開放口岸後，港口建設步伐不斷加快。1987年全面投產運營以來，港口吞吐量逐年攀升。1998年，吞吐量突破700萬噸。目前，防城港擁有泊位28個，其中萬噸級以上深水泊位14個；專用集裝箱泊位年通過能力為25萬標箱，港口年實際通過能力超過2500萬噸，是我國沿海20個主樞紐港之壹，承擔著我國西南、中南地區貨物進出的主要轉運任務。
防城港自對外開放營運以來，已與80個國家和地區的230個港口有貿易往來，並開通了韓國、馬來西亞、泰國、新國坡和經香港中轉世界各地的集裝箱航線，到海南的客貨滾裝航線也已開通。目前已建成糧食、化肥、水泥、礦石、煤炭、化工等外貿出口中轉基地。
2004年，全市完成貨物吞吐量近2000萬噸，其中防城港完成1600多萬噸。隨著防城港20萬噸級碼頭的投入使用，13-17號萬噸級泊位建設步伐的加快，今後五年內港口年綜合通過能力可望達到6000萬噸，港口核心競爭力將進壹步提高。