1993年，我國提出“質量興邦”戰略。在國家政策指引下，經過不懈努力和艱辛勞動，1994年8月13日，國家新聞出版署正式批準《中國食品質量導報》出版。
1994年10月1日出版試刊號，1995年1月1日，《中國食品質量導報》正式創刊，頭版和二版刊登了時任國務院副總理鄒家華等16位領導同誌祝賀本報創刊的題詞，三版刊登了122個祝賀報紙創刊的單位，這也是報社理事會的雛形。
1997年8月至2010年，經國家新聞出版署批準，《中國食品質量報》從每周三期改為日報，從對開四版黑白印刷擴為對開八版全彩色印刷。
2009年8月，在國家食物與營養咨詢委員會、北京市人民政府食品安全監督協調辦公室支持下，在北京市工商局、北京市消協、北京市食品協會的協辦下，《首都食品安全》周刊創刊。
2010年7月，國家食品藥品監管局國食藥監食函2010100號文，同意作為《中國食品質量報》業務指導單位。
2010年9月，國家新聞出版總署文件新出審字2010733號文，同意《中國食品質量報》更名為《中國食品安全報》。
2011年1月1日，《中國食品質量報》正式更名《中國食品安全報》。
2013年4月8日，經批準，國家食品藥品監督管理總局順延成為《中國食品安全報》的業務指導單位。