荔枝的根系因育苗方式不同而不同。真樹和嫁接樹都有發達的主根；高壓繁殖的荔枝(環枝)側根發達，無主根。荔枝的根系由許多粗大發達的側根和纖細密集的細根組成。新生的幼根白而脆，俗稱“豆芽根”。荔枝是壹種常見的水果，營養價值很高。荔枝的樹幹細膩光滑。壹般樹幹可能會有點淺綠，樹枝可能會有壹些斑紋。
荔枝樹高大，樹高超過16.0m，樹冠直徑超過15.0m，樹幹粗壯。樹皮粗糙，稍有裂紋，但比龍眼光滑，灰白色、灰褐色或深褐色。不同品種的樹有不同的皮膚顏色和粗糙度。水黑葉、棗等品種的樹幹呈灰白色，表皮光滑，而水黑葉、糯米、巨力等品種的樹幹呈深褐色，表皮粗糙。樹幹高度和樹冠大小與土壤、品種、繁殖方法和栽培管理有關。土層差或地下水位高，樹冠小；土層深厚肥沃，樹冠大。駁枝繁殖的植株主幹不明顯，多為3-4個主幹，形成多主幹型，植株樹冠較為開闊，呈半穹頂狀。植株粗壯，主幹明顯，單莖型，樹冠圓形。荔枝樹幹木質紋理細膩，棕紅色。