1、有效成分價值不同：靈芝孢子粉經過破壁及二氧化碳萃取純化得出，主要是由三萜類物質跟不飽和脂肪酸構成，而靈芝孢子油的成效成份包括三萜類靈芝酸、不飽和脂肪酸、靈芝多糖、微量元素、氨基酸、核苷類化合物、生物堿類化合物不飽和脂等。
2、靈芝三萜的含量不同：靈芝三萜是靈芝所特有的主要有效活性物質，靈芝三萜含量的高低被作為區分靈芝孢子油質量優劣的主要依據。壹般靈芝孢子油中靈芝三萜的含量是靈芝孢子粉的好幾倍，甚至幾十倍。
靈芝孢子粉的作用
保護心腦血管：服用靈芝孢子粉可以有效的擴張血管、促進血管血液循環、促進代謝，有降血脂、降血糖的功效，還可以增加心肌供氧量，改善動脈硬化。
潤肺平喘：靈芝孢子粉中含有靈芝酸、靈芝堿等成分，可以有效的抑制組織胺的釋放，來緩解支氣管疾病，具有止咳化痰的功效，對於慢性支氣管炎、慢性肺炎患者來說，是非常適合服用的。
以上內容參考?百度百科-靈芝孢子粉、百度百科-靈芝孢子油