作為大的分類，酶類分為“分解系酶”和“合成系酶”。比如說，將蛋白質分解成能被吸吸收(那樣)大小的氨基酸，通過分解系的酶和吸收後的氨基酸來合成自身身體所必需的蛋白質，這些都是根據酶來進行的。但是，為了區分生體內和生體外被使用的酶，稱在生體組織內被使用的酶為“代謝酶”，稱在腸胃內等生體組織外被使用的酶為“消化酶”，也可以說是為了方便起見。在生物化學上，分為酸化還原酶、轉移酶、加水分解酶、脫離酶、異性化酶和合成酶等六大類。溶菌酶。溶菌酶可作為壹種具有殺菌作用的天然抗感染物質，有抗菌、消腫及加快組織恢復功能等作用。常用於人體肌膚護理。果膠酶。果膠酶主要是由果膠裂解酶、聚半乳糖醛酸酶、果膠酸鹽裂解酶和果膠酯酶組成。果膠物質是高度酯化的聚半乳糖醛酸。果膠酶作用於果膠物質時，果膠裂解酶、聚半乳糖醛酸酶、果膠酸鹽裂解酶直接作用於果膠聚合物分子鏈內部的配糖鍵上，而果膠酯酶則使聚半糖醛酸酯水解，為聚半乳糖醛酸酶和果膠酸鹽裂解酶創造更多的位置。