壹、背鰭顏色不同，前者第壹背鰭為黃色或藍色，後者背鰭為紅褐色；二是價值不同，前者高於後者；第三，大小不同，前者最多能達到700多斤，後者壹般40-60斤。
黃鰭金槍魚:成年魚可長達3米，體重225公斤。壹般大魚可達2米，體重超過100公斤。身體呈紡錘形，最大叉長可超過2米。最高的身體位於第壹背鰭基部的中間。
臀鰭的第二背鰭和前鰭拉長。胸鰭較長，其末端達到第二背鰭起點以下。26~34鰓耙。體背深藍，腹部黃到銀色，常有壹些橫紋。背鰭、臀鰭、小鰭淡黃色，有黑邊。
藍鰭金槍魚:體長壹般在200 cm左右，可達458 cm，體重約150 kg，可達684 kg。而且它的下側和腹側銀白色有無色的橫線，與柱狀的無色點輪流出現。第壹背鰭為黃色或藍色；第二個紅褐色的；臀鰭和遊離鰭呈暗黃色，有黑邊。
2.其他人
藍鰭金槍魚是目前最大、經濟價值最高的金槍魚，而黃鰭金槍魚是目前最豐富的金槍魚。
當然，不管是藍鰭金槍魚還是黃鰭金槍魚，售價都比普通魚高，營養也比很多種類的魚高。