上呼吸道感染在治療上以解熱鎮痛、化痰和其他對癥治療的藥物為主。
1.抗病毒藥物：常見藥物包括利巴韋林、抗病毒口服液等，但引起上呼吸道感染的病毒有很多，目前尚無特效抗病毒藥物。
2.解熱鎮痛藥：對於上呼吸道感染伴有頭痛、發熱、肌肉酸痛等癥狀的患者，可適當使用阿司匹林、布洛芬、雙氯芬酸、對乙酰氨基酚、吲哚美辛等非甾體抗炎類藥物，對緩解癥狀有積極的作用。
3.鎮咳化痰藥：①鎮咳作用，可使用右美沙芬、磷酸可待因、奧索拉明、噴托維林、磷酸苯丙哌林、福爾可定等藥，不建議應用強效鎮咳藥；②祛痰作用，可選用溴己新、氨溴索、桃金娘油等。
4.對癥治療藥物：如患者伴有流涕、噴嚏等癥狀，可使用氯雷他定等抗組胺藥物。此類藥物有助於減輕上呼吸道感染伴噴嚏等癥狀。
目前市場上有很多對癥治療藥物的復方制劑效果也很好，具體藥物應在醫生或藥師的指導下使用。上呼吸道感染的患者要註意休息，提高免疫力，不吃藥也是可以痊愈的。