治療的主要目的是阻止澱粉樣蛋白的進壹步沈積，促進其吸收，減少前體蛋白的產生對延緩疾病進展有明顯作用。以AA澱粉樣變為例，治療潛在疾病可使澱粉樣沈積物消退，如用烷化劑治療類風濕性關節炎，用秋水仙堿治療家族性地中海熱，可保護腎功能不受損害。腫瘤切除有時可以使澱粉樣物質消散。但當AL為澱粉樣變時，用細胞毒藥物抑制漿細胞生長的治療效果並不理想。血液透析相關澱粉樣變患者腎移植後，β2-M可迅速恢復正常，澱粉樣沈積物也會消失。肝移植已成功用於治療TTR基因突變引起的家族性澱粉樣變多發性神經病。當AL澱粉樣變累及心臟時，可以考慮化療或心臟移植。總之，該病無特效療法，仍以支持療法為主，並積極處理器官衰竭。
近年來，隨著新藥和臨床檢測方法的出現，澱粉樣變的治療取得了很大進展。中國人民解放軍南京軍區總醫院腎內科，依托院士平臺，是國內較早開展自體幹細胞移植治療al澱粉樣變的單位。目前涉案人數已超過50人，治療效果令人滿意。以下鏈接是CCTV10對我科典型病例的報道，有興趣的患者可以看看。