風味發酵乳與酸奶在本質上有所區別，盡管它們都屬於發酵奶制品。酸奶的主要成分是牛奶，經過乳酸菌發酵而成，被廣泛視為壹種健康的飲料。它富含乳酸菌和鈣，有助於減肥並促進腸胃健康。然而，風味發酵乳則是在乳制品的基礎上添加了果粒或果蔬汁，雖然營養更加全面，但牛奶的原汁原味營養有所稀釋，其營養價值並不如酸奶高。
相比之下，酸奶中的蛋白質和鈣含量通常僅為風味發酵乳的1/3，並且糖分含量較高。如果僅僅追求乳酸菌的攝入，要註意的是，只有菌落總數達到10的8次方的活性乳酸菌，才能對腸道健康產生明顯改善效果。因此，盡管風味發酵乳可能口感更豐富，但從營養價值角度看，酸奶仍然是更好的選擇。