1.有機大米生產加工中絕對禁止使用農藥、化肥、激素等合成物質，不允許使用基因工程技術；普通大米沒有這些限制。
2.有機水稻對土地生產的轉化有嚴格的規定。考慮到有些物質會在環境中殘留很長時間，土地生產其他食物生產有機大米需要兩到三年的時間，而普通大米對轉化期沒有要求。
3.有機大米的數量是嚴格控制的，需要固定的地塊，固定的產量。對普通大米的生產沒有這麽嚴格的要求。
4.按照國際慣例，有機食品標誌認證的許可有效期為壹年。壹年期滿後，可以申請“保證認證”，經檢查考核合格後，可以繼續使用有機食品標誌。