每只圈養的熊貓都有壹份記錄，裏面詳細介紹了它的父母和所有的親戚，通常會據此確定熊貓的交配對象。壹般來說，雄性熊貓的親戚越少，它能得到的後代就越多。只要兄弟姐妹不多，壹只雌性熊貓到了壹定年齡就會繁殖。這種雜交是被鼓勵的，但為了保證繁殖的成功率，雌性大熊貓在這種雜交後會進行人工授精。
圈養確實存在近親繁殖，這不是必然的而是這些單位出於某些對他人不人道的原因故意為之。尤其在成都大熊貓繁育基地，被稱為“近親基地”。比如北京動物園的孟和肖兄弟，他們的父母是表兄弟，在鄂爾多斯借來的兩只熊貓的父母也是表兄弟。思遠在成都大熊貓繁育基地的父母是同父異母的兄弟。