1.對養殖環境要求高:海膽的養殖需要壹個相對適宜的環境，比如對水溫、水質、水流的要求很高，需要大量的金錢和精力來營造適合海膽生長的養殖環境。
2.飼料管理難點:海膽的飼料種類少，需要特殊的藻類飼料，而且飼料的質量和營養也要有保證，飼料的數量也要控制，這對養殖戶來說是壹個挑戰。
3.防病治病難:海膽的養殖需要註意疾病的防治，如細菌性疾病、寄生蟲等，海膽的免疫力較弱，易受外界環境和病原體的影響，防治難度較大。
4.市場波動:雖然海膽的市場價值高，但市場波動和價格波動大，對養殖戶來說也是壹個風險因素。