1，含糖量不同:北碚南瓜含糖量是普通南瓜的1.6倍，且以優質木糖醇為主，高血糖患者也可適量食用。普通南瓜的含糖量比北碚南瓜低，主要成分是果糖。適當攝入不會對人體產生不良影響，但腸道不能吸收太多果糖。當人體攝入大量果糖時，容易引起腹瀉等不適癥狀。
2.營養成分不同:北碚南瓜和普通南瓜富含胡蘿蔔素、維生素A、碳水化合物、礦物質等營養成分。每100g南瓜含碳水化合物6.5g，維生素A 2553.9g，胡蘿蔔素7116g。碳水化合物作為重要的供能物質，適量食用可以補充所需營養，增加飽腹感。