維生素B12缺乏:維生素B12是造血過程和神經系統所必需的。維生素B12幾乎只存在於動物性食物中，螺旋藻、海洋植物、大豆發酵食品提供的維生素B12無活性。
缺鐵:植物性食物只含有非血紅素鐵，不如肉類中的血紅素鐵。植物性食物對鐵的吸收較差，所以雖然素食中的鐵含量高於肉類食物，但素食中的鐵存量較低。素食也可能導致貧血。這種情況多發生在兒童和婦女身上。
缺鈣:缺鈣對於不吃乳制品的素食者來說是很常見的。純素食者的鈣攝入量低於乳制品和雞蛋素食者和雜食者。