敏感體質的人可能會因口服酵素而出現過敏反應，如腹痛、出汗、便秘等。這時候要註意不要空腹吃酵素，壹次量不要太多。應該循序漸進。
2.自制水果酵素含糖量太高。
自制水果酵素壹般是按照水果和糖的比例在密閉容器中發酵。壹般放糖多是為了考慮口感等因素，所以自制的酵素壹般含糖量都比較高，不適合所有人。
3.自制酶過程會產生病菌。
自制水果酵素不靠譜，在制作過程中會造成大量微生物過度生長。有益菌生長的同時，其他病菌也會大量繁殖，這對人體健康是壹個隱患。如果需要吃酵素，也要買正規產品。