新疆是中國苜蓿種質資源最豐富的地區。紫花苜蓿與紫花苜蓿的天然雜種非常普遍,變異類型多樣。根據閔等人(1995)的調查研究,所謂“黃花”苜蓿群體中的紫花、黃花、半黃花、半紫花以及變異較大的植株,都是紫花苜蓿與紫花苜蓿的雜交後代。由其育成的新品種,或苜蓿與黃三葉人工雜交育成的新品種,應歸入雜交苜蓿。