但科學研究發現，蕨菜中所含的與癌癥相關的物質包括苯草酸、蕨內酰胺、黃烷醇、菖蒲黃素以及壹些與菖蒲黃素類似的物質。這些致癌物質在蕨菜根莖中的含量最高，其次是葉片。
日本學者發現，在日本食管癌高發區，經常吃蕨菜的人致癌。中國學者研究發現，長期用蕨菜餵養的牛，膀胱癌發病率也很高。
此外，根據世界上許多國家對蕨菜的致癌實驗，蕨菜可誘發大鼠腸癌、乳腺癌、膀胱癌和白血病。
科學家還對加工過的蕨菜進行了致癌試驗，結果顯示，即使是加工過的蕨菜也會誘發癌癥。
因此，專家建議，最好不要吃蕨菜。