細菌性皮膚感染和真菌感染的區別在於皮疹的形式。對於真菌引起的體癬、股癬，皮膚表面可出現環狀或類環狀紅斑，中心愈合，邊緣略隆起，布滿細鱗片。如果是酵母菌和糠秕孢子菌感染引起的汗斑，可出現褐色斑塊，其上可有細小鱗屑，伴有輕微瘙癢或不瘙癢。細菌感染引起的疾病，如丹毒，可引起水腫紅斑，皮膚溫度升高，局部壓痛，炎癥感染癥狀更明顯。
細菌性皮膚感染和真菌感染在治療上是有區別的。真菌感染可外用鹽酸特比萘芬凝膠，細菌感染可外用夫西地酸軟膏。