去醫院做囊腫手術可以醫保報銷。只要患者有合作醫療和醫保，就可以報銷，在正規醫院住院後就可以報銷。門診治療壹般不報銷。囊腫壹般是良性疾病，較小的囊腫可以在普外科門診手術室做手術，費用較低，手術費用幾百元左右。加上麻藥和麻醉的費用，壹般要幾百元。如果是較大的囊腫或者是較深的囊腫，需要住院進手術室做手術，那麽手術前需要做簡單的采血、心電圖、胸部x光檢查，總費用在2000元左右。這些費用都是醫保報銷前的費用。