在《本草綱目》中，紅米被稱為無毒品。但國際相關食品安全機構並未對紅曲米和紅曲米色素的毒性進行評估。紅曲米及其色素的毒性數據也相當有限。
紅曲米發酵過程中產生的莫那可林K與降膽固醇藥物洛伐他汀中的有效成分具有相同的化學性質。食用含有莫那可林K的產品可能會影響血液膽固醇水平，並可能引起與服用洛伐他汀相同的副作用(如肝中毒和肌肉問題)和藥物相互作用。雖然消費者無法得知紅曲米及其制品中莫納可林K的含量，但美國美國食品藥品監督管理局進行的檢測顯示，作為食品銷售的紅曲米不含或僅含少量莫納可林K