果糖二磷酸鈉口服液的副作用主要是消化系統的輕度癥狀,如腹脹、惡心、上腹部燒灼感、便溏等。,患者壹般可以在不停藥的情況下耐受。有研究報道,部分患者口服果糖二磷酸鈉溶液後出現過敏反應、心律失常、頭暈、頭痛等。
高磷血癥和腎衰竭患者禁用口服果糖二磷酸鈉溶液。