紅豆杉本身有毒，全株有毒，果實更有毒。它含有紫杉醇，能被人體吸收，迅速作用於心臟和呼吸系統，所以人壹旦食用，會傷害心臟和呼吸系統，嚴重的會致命。但是在醫生的指導下，還是有藥用效果的。
藥用價值
紅豆杉的藥用價值主要在於其提取物——次生代謝衍生物——紫杉醇。紫杉醇最初是作為抗腫瘤活性成分從短葉紅豆杉樹皮中分離出來的。是治療轉移性卵巢癌、乳腺癌的最佳藥物之壹，對肺癌、食道癌也有明顯療效，對腎炎、細小病毒炎癥有明顯抑制作用。
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