1，加工方法不同:山茱萸的制作方法是選取幹凈的山茱萸，加入黃酒攪拌均勻，放入密封容器中，放入有水的鍋中，蒸至酒完全吸收，取出晾幹。山茱萸是用成熟幹燥的果實，用小火或開水烘烤，去核，曬幹至幹。
2、功效不同:酒山茱萸具有滋補肝腎、澀精固脫的作用，其功效更傾向於溫肝腎。山茱萸的功效是補益肝腎，澀精，澀味，入肝腎經，能補腎固澀。