1，抗菌藥物:青黴素類(如阿莫西林)是治療急性扁桃體炎的主要藥物，使用這些藥物前壹定要做皮試，避免過敏反應。同時，患者可根據自身實際情況選擇頭孢唑啉、克拉黴素等抗生素。此外，具有抗菌作用的漱口水也可用於治療扁桃體炎，如復方硼砂溶液、復方氯己定漱口水、1∶5000呋喃西林溶液等。
2.免疫增強藥物:患者通過註射胎盤球蛋白和轉移因子增強抗病能力，對慢性扁桃體炎的治療有積極作用。
3.中藥:有些中藥對治療扁桃體炎也有壹定療效，如銀翹柑湯、清咽防腐湯等。