主要來源於生物發酵,工業中大量的酶都是微生物發酵產生的。壹般需要在適宜的條件下培育所需的菌種,讓其繁殖以獲得大量的酶制劑。也可從生物中提取,但成本較高,多用於科研。
生活中最常見的酵素有釀造、醋、醬油、酸奶。此外,還有壹些用於治療胃腸疾病,如母食片。