發酵腐乳容易被微生物汙染。臭豆腐吃多了，會對人體產生不良影響。尤其是有口腔潰瘍和扁桃體炎的人，很容易長青春豆。另外，腐乳的含鹽量普遍較高。高血壓、心血管疾病、痛風、腎病、消化道潰瘍患者應少吃或不吃，以免加重病情。還有，吃豆腐乳對人體健康不好。泡菜和豆腐乳不宜多吃，常與粥同用。最好壹周只吃壹兩次。營養專家解釋，鹹菜、豆腐腦營養價值低，太鹹；為了保存泡菜、豆腐等壹些加工食品，可能會添加防腐劑，對身體有害。