嶗山黃檀的香味獨特濃郁，需要適當保存。最好放在玻璃或金屬密封容器中，存放在溫度低、濕度適中的地方。即使不戴，也要密封在陰涼的環境裏。
嶗山檀不同於其他菩提手串，它不適合把玩，而是適合佩戴。它會不斷分泌油脂，帶白手套玩會更好。
夏季佩戴時，避免頻繁接觸汗液、油脂、蠟、溶劑、酸堿、化學品。經常觸摸會堵塞檀香的毛孔，影響香味。