新鮮黃花菜含有微毒的秋水仙堿，加熱時易分解，冷水中易溶。黃花菜先用開水焯水，再用冷水浸泡壹段時間，然後取出瀝幹水分，曬幹即可。選擇在陽光穩定的日子晾曬，最好是在水泥地面上，不要用壹些吸水性強的竹架。
通常新鮮黃花菜收獲的花蕾要隨收獲壹起蒸，防止采集的花蕾繼續開放，影響品質。蒸鮮黃花菜的方法是:將采集的花苞鋪在沸騰的蒸籠中，蓋上蒸籠蒸幾分鐘，直到花苞的顏色由黃色變為淡黃色，用手捏把手時，花苞會下垂，說明蒸好了。