和之前的系列遊戲壹樣，遊戲記錄了壹個年輕的寶可夢訓練師訓練寶可夢，與寶可夢戰鬥，挫敗敵對組織計劃的故事。
作為《寶可夢》主系列中第壹款非遊戲狂開發的遊戲，這款遊戲由ILCA制作。正因為如此，這部作品的角色與以往大不相同。
“寶水晶版”的遊戲舞臺設置在官渡區和西城區。官渡地區起源於日本關東。都市圈的設計來源於日本的關西和東海，這兩個地方的很多寺廟和日本傳統建築都在都市圈有所體現。
金曼市類似大阪，其磁懸浮列車直達官渡地區的黃金城，類似連接大阪和東京的新幹線。此外，朱元城與首都相似，朱元被燒毀的塔和鐘樓與羅孔基和慈昭寺相似，羅孔基標誌性的鳳凰雕塑是鳳凰王的原型。