傳統意義上的咖啡，對咖啡豆的研磨、熬煮、過濾，以及器皿的選擇、不同的勾兌手法都非常講究。在合成過程中，速溶咖啡原有的營養保健成分被破壞消失。
喝速溶咖啡的時候，雖然還是咖啡的味道，但是已經失去了營養和保健作用。此外，咖啡中的防腐劑、色素、甜味劑等添加劑在人體內無法消化吸收而不斷沈積，會對人體造成傷害，加速人體細胞衰老。
咖啡中含有較多的咖啡因，能刺激胃酸分泌，增加胃酸濃度。早上空腹喝咖啡不僅會損傷胃黏膜，還會引起胃痛、胃灼熱甚至惡心，還可能導致心跳加快、胸悶、心悸。
速溶咖啡含有大量糖分，不僅會導致肥胖，還會誘發壹些疾病。
另外，咖啡雖然有提神的作用，但長期飲用會加速B族維生素的消耗，缺乏B族維生素的人更容易感到疲勞。