1、樣本選取不同：抽樣調查中的調查單位是按隨機原則從全部總體單位中抽選出來的，不受人的主觀因素所影響。重點調查是在調查對象中，選擇壹部分重點單位作為樣本，且重點單位標誌總量全部單位標誌總量的絕大比重。
2、調查目的的不同：抽樣調查的目的，是以樣本量來推斷總體的數量特征；重點調查的目的，是為了掌握現象總體的基本情況。
3、適合場地不同：抽樣調查最適合於不能或很難進行的全面調查，而又需要全面數值的場合，在能進行全面調查的場合也有獨到的作用。重點調查適用於部分單位能比較集中地反映所研究的項目或指標的場合。
4、推斷總體的可靠程度不同：抽樣調查可以計算和控制推斷的可靠程度。重點調查不能推斷總體總量。