壹般將浸泡過的木耳放入冰箱的冷藏區，可以起到保存和保存的作用，壹般可以持續1-2天但限制也為2天。雖然冰箱冷藏區的溫度遠低於室溫，但只能減緩木耳的變質速度，不能阻止木耳的變質。
此外在保存浸泡過的木耳時，有必要將其包裝在保鮮袋中，這可以減少壹些微生物的汙染。炒過的木耳過夜壹般不建議吃。炒過的木耳在儲存過程中會變質，食用變質的木耳可能會對身體產生不良影響，甚至產生毒性反應。
此外通常無法通過外觀判斷細菌是否在變質的木耳中繁殖，因此為了避免這種風險，盡量不要吃隔夜的木耳。過夜放置的木耳易滋生病原菌，食用後可能引起腹痛和腹瀉等急性胃腸炎癥狀，或食用後引起頭暈、心悸和嘔吐等嚴重毒性反應。
建議患者在日常生活中盡量多吃新鮮食物，即使隔夜的食物沒有變質，味道和營養也會在壹定程度上減少，保持原料新鮮有利於健康。