糖蜜主要可用於家畜、家禽、水產和特種養殖，即豬、牛、雞、鴨、魚蝦等。也可在其他特種養殖飼料中作為添加劑和增效劑。還可用作制粒的粘合劑和抗氧化劑，因為它具有很強的還原性，能防止和減輕飼料的空氣氧化。
糖蜜發酵液不僅富含高濃度的腐熟度、腐植酸、生化黃腐酸、碳水化合物和具有高吸收能力的NPK，還富含發酵階段形成的未知生長因子，通過添加人工合成激素可以刺激植被，主要用作固體有機顆粒肥料和葉面肥的輔料，甚至可以直接與水混合作為成品葉面肥和灌溉肥。
如果用於水產養殖，主要用於肥水、防病促長、消除水中氨氮和亞硝酸鈉的危害。如果與“生物凈水器”配套，可以凈化水質，消除水體富營養化，實現水產安全養殖和生態平衡。