1、由於長江及其支流的大堤壹般都是土堤，在取土築堤時往往在背水面形成水坑、池塘和低窪地，成為克氏原螯蝦生長和繁殖的最佳場所。克氏原螯蝦喜歡穴居，打洞速度很快，範圍也較大，因此克氏原螯蝦對於堤壩的危害比白蟻的危害更大 。
2、克氏原螯蝦對魚類尤其是幼魚也有很大的殺傷力，由於小龍蝦繁殖快，所以會爭奪大量的魚類食物，並且還會以幼魚為食。
3、克氏原螯蝦在梯田裏泛濫成災，由於克氏原螯蝦在提點上“打洞”直接造成灌溉用水流失及田埂坍塌，影響到了梯田的保護和申遺工作。
4、克氏原螯蝦屬於入侵物種，數量龐大的克氏原螯蝦破壞了當地的原有生態。除了與原來的魚類、泥鰍等爭奪生存空間，小龍蝦還會啃食水稻作物，影響後期的糧食產量。