1.來源:菊苣菊糖來源於菊苣，菊芋菊糖來源於菊芋。
2.成分:菊苣比菊芋含有更多的膳食纖維，對益生元和腸道改善有很好的作用，並可水解為天然低聚果糖。
3.口感:菊苣來源的菊粉流動性和色澤相對更好，以中長鏈為主，對質地改善作用更明顯，增加了膳食纖維的細膩口感。相比之下，來自菊芋的菊粉主要是短鏈的。雖然益生元效果不如低聚果糖，但是價格便宜，有中長鏈的分子結構支撐，可以很好的與固體飲料、酶等其他產品混合。
4.應用領域:菊苣菊粉在國外應用廣泛，尤其是在烘焙領域。菊芋中的菊粉更廣泛地應用於固體飲料、酶等。
總的來說，菊苣菊粉和菊芋菊粉各有特點，需要根據具體的應用場景和需求來選擇。