主要區別有，外觀性狀不同、粘性度不同、用途不同，具體如下：
壹、外觀性狀不同
1、玉米澱粉
玉米澱粉是呈白色微帶淡黃色的粉末。
2、紅薯澱粉
紅薯澱粉色澤較黑，呈顆粒狀，較為粗糙。
二、粘性度不同
1、玉米澱粉
玉米澱粉的粘度較紅薯澱粉低，粘度容易控制，適宜炒菜勾芡使用。
2、紅薯澱粉
紅薯澱粉的粘度較玉米澱粉高，因為粘度較難控制，因此，在中菜勾芡時較少使用地瓜粉。
三、用途不同
1、玉米澱粉
玉米澱粉常用作布丁等食品的凝固劑，在中國菜和法國菜裏用作增稠劑，中國菜裏的勾芡。澱粉作為原料可以直接用於粉絲、粉條、肉制品、冰激淩等方面應用。
2、紅薯澱粉
因為粘度較難控制，多應用於中式點心制作，如山粉餃等。由於口感爽滑有韌性，它還很適合做粉絲、粉皮等。