我國利用真菌作為保健品和入藥有著悠久的歷史，許多真菌已被用作生藥或制成中成藥。食用菌的主要保健和藥理作用如下：
（1）抗癌作用：如香菇多糖和豬苓多糖對小鼠肉瘤180的增殖有抑制作用，猴頭菇多糖被用於輔助治療胃癌、食道癌等。
（2）對心血管系統的作用：如靈芝可降低小鼠的耗氧量，提高耐缺氧能力，其註射液能改善心律失常和胰腺微循環；銀耳對治療慢性肺源性心臟病有較好的效果。
（3）對肝臟的作用：如香菇多糖對慢性病毒性肝炎有壹定的治療效果，雲芝、豬苓在治療肝炎方面也有壹定的作用。
（4）對神經系統的作用：如冬蟲夏草的乙醇提取物能抑制小鼠自主活動，延長睡眠時間；安絡小皮傘有較好的鎮痛作用。
（5）抗炎作用：如銀耳、冬蟲夏草、蜜環菌、竹黃菌均有壹定的抗炎作用。