當我們用肥皂和水洗臉和洗澡時，皮膚獨特的天然保護層中的鏈狀脂肪酸很容易被沖走。此時皮膚無保護，容易被細菌感染。椰子油中含有的中鏈甘油三酯與親脂性細菌接觸後會形成具有抗菌殺菌功能的中鏈脂肪酸。因此，沐浴後，宜取適量塗抹於面部或身體，按摩1-2分鐘，十分鐘左右滲入皮膚，使身體的天然化學保護膜得以恢復。而且，長此以往，皮膚會變得光滑潤澤。
也可以在敷面膜前，在臉上塗上椰子油，按摩1分鐘，也可以保護皮膚。
椰子也可以用來卸妝，防止曬傷，治療皮膚病，因為它有很強的清潔作用。方法是相似的。但用椰子油卸妝時不要按摩，以免皮膚吸收殘妝。