1.由於檸檬蜂蜜水含有豐富的果酸和糖分，胃酸過多的人不宜飲用，否則可能會加重胃酸癥狀。另外，感冒的人、痰多的人、胃寒的人、腹脹的人、胃病患者都不要喝檸檬蜂蜜水。
2、檸檬蜂蜜水不宜大量飲用，適量為最佳，最多500ml。因為它的酸性很強，喝多了可能會引起腸胃不適。
3、檸檬蜂蜜水不宜沖泡過濃，帶著淡淡的酸味喝就夠了。因為濃度越高，酸性越強，會對腸胃和牙齒造成傷害。
4.沖泡檸檬蜂蜜水不要用開水或太熱的水。用冷開水或溫開水為宜。因為太燙的水會破壞蜂蜜中的有效成分。
5、月經期不宜喝冰鎮檸檬蜂蜜水，否則可能會引起腹痛。
6、檸檬蜂蜜水不宜與阿司匹林同服。