過量使用左旋肉堿會對循環系統和消化系統產生不良影響。常見的危險和副作用如下:
1、循環系統:左旋肉堿使用過量，脂肪供給過多使心臟超負荷，可能導致心動過速、心律失常、心慌氣短等不適，甚至容易誘發心律失常。另外，服用的人大多是減肥的人，也可能配合節食達到減肥的效果，可能會使心臟不適更嚴重；
2、消化系統:左旋肉堿促進脂肪轉化為能量，會增加腎臟和肝臟的負擔。所以有些使用者可能會出現胃腸道副作用，如消化不良、惡心、嘔吐、腹痛、腹瀉甚至食欲不振；
3.其他:左旋肉堿能使人興奮，對於睡眠質量差的人可能會影響睡眠質量。劇烈腹痛、腹瀉等癥狀可能導致電解質紊亂，出現頭痛、頭暈、乏力、失眠、口渴等癥狀。部分患者可出現肝功能損害、註意力不集中、皮膚過敏等不良反應。